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La Nutrition végétale   La photosynthèse L'autotrophie Les structures en jeu Le mécanisme - la phase claire La photolyse de l'eau et le transport acyclique des électrons Le transport cyclique des électrons La formation d'ATP - la phase obscure Formation d'ATP L'accumulation des protons H+ dans l'espace intrathylakoïdien entraîne un déséquilibre avec la concentration des protons du stroma. On a mesuré que le pH de l'espace intrathylakoïdien descend à 5 alors que celui du stroma monte à 8. Pour conserver l'équilibre, ces protons sortent par le seul passage possible : les sphères pédonculées. Ces molécules traversent la membrane du thylakoïde et forme un canal au travers. Lors du passage de trois protons, la sphère pédonculée rajoute un groupement phosphate à de l'ADP (Adénosine diphosphate), créant ainsi de l'ATP (Adénosine triphosphate). Or cet ATP est une molécule essentielle à la vie car elle libère beaucoup d'énergie lors de sa consommation. Elle permet ainsi de faire fonctionner des réactions fortes consommatrice d'énergie qui ne pourraient pas avoir lieu d'elles-mêmes. Ainsi la photosynthèse permet de fabriquer des transporteurs d'électrons et de l'ATP. Ces deux substances étant vitales pour le bon fonctionnement d'un organisme. Une autre source d'ATP, qui fonctionne selon le même principe (excepté que l'énergie de départ est d'origine chimique et non lumineuse) est la respiration. Les plantes respirent comme tout êtres vivants.