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Si on mesure l'intensité de la photosynthèse en fonction de la longueur d'ondes on remarque la similitude avec le spectre d'absorption de la chlorophylle. L'intensité n'est forte que si l'on se trouve dans les longueurs d'ondes d'absorption du pigment.

Cela explique la distribution des végétaux aquatiques sur la marge littorale. En effet l'eau de mer va jouer le rôle d'un filtre vis-à-vis des longueurs d'ondes. Elle absorbe les longueurs d'ondes des plus grandes aux plus petites, donc du rouge vers le violet.

  • Les radiations de longueur d'ondes voisines du rouge sont rapidement absorbées par l'eau, ainsi elles pénètrent peu en profondeur, uniquement quelques mètres. Les végétaux chlorophylliens ne pouvant absorbés que cette couleur sont donc cantonnés à rester près de la surface.
  • Les radiations orange et jaune descendent plus profond, ce qui profite aux algues brunes possédant des phycocyanines et des caroténoïdes,
  • Les radiations vertes sont celles qui pénètrent le plus en profondeur (jusqu'à 90 m). Seules les algues rouges, qui possèdent des phycoérythrines, peuvent utiliser ces radiations.

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