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Le règne des Protistes   Les premiers pluricellulaires Dès la formation de cellules eucaryotes des essais d'association entre cellules ont été tentés. Cela a pu être provoqué par des divisions incomplètes (plusieurs noyaux dans une même cellule comme chez les Myxomycètes), ou plus simplement par le fait que les cellules filles ne séparaient pas (peut-être comme chez Chlamydomonas, où les cellules issues des divisions restent un temps ensemble, enfermées dans la coque mère ou comme chez les Acrasiomycètes). Si l'association entre plusieurs cellules entraîne pour chacune d'elle une difficulté plus grande à chercher sa nourriture, ce désavantage est compensé par la protection et la coopération qu'apporte la vie à plusieurs. Plus le nombre de cellules par colonie s'est accru, plus les cellules ont du se spécialiser. En effet les cellules les plus éloignées de la surface de la colonie, ne pouvant plus se nourrir seules, ont du compter sur leurs voisines, et en ont profité pour remplir plus efficacement une autre fonction (qui profitera à l'ensemble de la colonie). Petit à petit se sont ainsi différenciés différents types de cellules. L'activité des gènes devenus inutiles a ensuite été progressivement réprimée sous l'action de gènes régulateurs. On peut alors dire que les cellules sont alors réellement spécialisées. Une étape importante dans cette différenciation cellulaire a été la séparation entre les cellules intervenant dans la reproduction, les cellules germinales, et les autres cellules de la colonie-organisme, les cellules somatiques. On peut observer une telle séparation des tâches chez Volvox, une Algue verte dont les cellules ressemblent fortement à l'algue unicellulaire Chlamydomonas. Par la suite la faculté des cellules à s'associer selon leur type, a permit de structurer les amas cellulaires en de vrais organismes. Ainsi certaines cellules se sont spécialisées dans les divisions cellulaires, mitose (pour la croissance) ou méiose (pour la reproduction), d'autres dans la capture d'aliments ou la photosynthèse, d'autres dans les mouvements (pour les animaux), ... C'est il y a environ 700 millions d'années que les formes de vie pluricellulaires se sont réellement développées comme le montre le gisement fossilifère d'Ediacara.